多年来，遵义医科大学科学研究坚持面向科技前沿、面向人民生命健康，围绕贵州特色产业发展及地方经济社会发展需求，潜心打造以科技领军人才为核心、重点科技平台为载体、重大科技项目为牵引、重要科技成果为标志的科技创新体系。

学校有各级科研平台62个，其中科技部生物样本库2个，博士后科研流动站（临床医学）1个、教育部重点实验室2个、教育部国际合作联合实验室1个、省部共建协同创新中心1个，全国科普教育基地1个，省级重点实验室4个，省级临床医学中心、工程研究中心和贵州省2011协同创新中心9个。近五年，获国家自然科学基金项目402项，其中重点项目1项，国家社会科学基金项目9项；获省部级以上成果奖41项，其中国家科技进步奖二等奖1项;何梁何利科学与技术创新奖1项，为贵州省医学领域首个;获贵州省2022年度十大科技创新成果“间充质干细胞应用研究及成果转化利用”1项;省科学技术奖38项（其中最高科学技术奖1项、一等奖3项、二等奖9项、三等奖20项、合作奖5项），获贵州省医学科技奖32项（其中一等奖6项、二等奖8项、三等奖18项）。

学校充分发挥在生物医药领域的优势，紧密围绕“十四五”规划和2035远景纲要，积极推动我省大健康及生物医药产业发展，联合地方政府和相关企业，长期致力于产学研用合作，深挖地方特色资源，将医学科研成果转化成大健康产品，服务地方经济社会发展。2019年，我校凤冈锌硒茶研究小组通过现代科技手段研究凤冈锌硒茶的保健功能，并将成果编制成《遵义医科大学凤冈锌硒茶研究成果汇编》，推动了凤冈锌硒茶产业化发展，相关事迹被贵州电视台《百姓关注》栏目予以跟踪报道。我校食用菌研究团队是省内最早开展食用菌菌种库构建和液体菌种研究的团队，成员深入安龙县、正安县等地指导当地农户开展食用菌的人工栽培，团队成员还被聘为中央电视台《舌尖上的中国》关于食用菌介绍的顾问。近5年，我校主持多个教育厅高校服务农村产业革命科研项目，在项目实施中获得授权专利6项，新产品20种，新品种34种，建设技术平台6个，新技术3项，带动农户2000余户，培训人数200余人，培养人数100余人，新增就业人数100余人。为乡村振兴及巩固脱贫攻坚成果作出了积极的贡献。